El Plan de Estudios es flexible y está compuesto por 10 asignaturas obligatorias comunes a ambas menciones y 10 asignaturas electivas, que se relacionan con los estudios regulares de las carreras que se imparten en las distintas Facultades e Institutos de la Universidad. Además de los 4 semestres regulares, se ofrecen periodos académicos extraordinarios en los meses de diciembre y enero, donde se pueden recuperar asignaturas reprobadas o avanzar en los estudios.

Los graduados del Programa de Bachillerato pueden continuar sus estudios en la carrera que escojan, incorporándose a ellas mediante un sistema especial de vacantes, que se ofrecen anualmente a Bachillerato y en cada una de las carreras de la Universidad, y luego de haber cumplido con la normativa establecida del Programa. Las asignaturas comunes y electivas cursadas durante su permanencia, son reconocidas cuando corresponden a las del plan de estudios de la carrera en la que el graduado se incorpora (los planes de estudios pueden ser modificados en función del mejoramiento continuo de la carrera).